北京2019年7月(yue)10日 /美通社(she)/ -- 健康是所(suo)有人(ren)的(de)追求(qiu)，隨著技(ji)術進步(bu)基于“個人(ren)”基因、病史等大數據(ju)分析的(de)“精準醫(yi)療”，正(zheng)成為各國醫(yi)學界探(tan)索的(de)新(xin)方向。

近(jin)日，中(zhong)科(ke)曙(shu)光在其官微發布了《先(xian)進(jin)計(ji)(ji)(ji)算(suan)“精(jing)準(zhun)醫療”領域三大趨勢》（以下簡稱“趨勢”），“趨勢”指(zhi)出：1、精(jing)準(zhun)醫療對于HPC（高性能計(ji)(ji)(ji)算(suan)機(ji)）的(de)需求將(jiang)隨著海量(liang)增(zeng)加的(de)基因數據(ju)和復雜的(de)組學分析流(liu)程而全面升(sheng)級；2、云計(ji)(ji)(ji)算(suan)將(jiang)成(cheng)為“精(jing)準(zhun)醫療”首選場(chang)景；3、不(bu)同研究(jiu)機(ji)構將(jiang)聯合建立(li)可(ke)控的(de)共享基因數據(ju)庫。

云計算將成為“精準醫療”首選場景

自2015年美國(guo)前總(zong)統奧巴馬(ma)提出“精準醫療(liao)(liao)計(ji)劃(hua)”以(yi)來，包括我國(guo)的十余國(guo)家已提出相關計(ji)劃(hua)。2016年，中國(guo)科技部首次(ci)召(zhao)開“國(guo)家精準醫療(liao)(liao)戰略專家會議”，計(ji)劃(hua)在2030年前投入600億元推動“精準醫療(liao)(liao)”發展。而“精準醫療(liao)(liao)”已離(li)不開先(xian)進計(ji)算的支持。

《先進(jin)計算“精準醫療”領(ling)域三大趨勢(shi)》指出，隨著“精準醫療”的(de)基(ji)因檢測、組(zu)學分析等技(ji)術的(de)發展，對“先進(jin)計算”平(ping)臺提出了更(geng)高的(de)性(xing)能與兼容性(xing)要求。

如針對“精準醫(yi)療”第三代基(ji)因測(ce)序、組學分析等技術(shu)的大批(pi)量、小規模，一(yi)次提交成(cheng)百上千應用數據處理需求特(te)點(dian)，以及多種基(ji)因檢測(ce)及特(te)征分析軟件并(bing)存、更新(xin)迭代快且無統(tong)一(yi)標準的局面，HPC將全面升(sheng)級，具備PB（十(shi)億(yi)億(yi)字節）級存儲架構(gou)下(xia)，解(jie)決數據復雜流程分析能(neng)力，并(bing)適應軟件的多樣與多變。

目前，“個人”基(ji)因(yin)測序(xu)成本已(yi)下(xia)降到(dao)幾百美金，但個人的(de)“基(ji)因(yin)譜(pu)”如(ru)何才能得到(dao)系統的(de)“精(jing)準醫療”檢測，業界還沒有完善產(chan)業模式。但像谷歌(ge)、微軟已(yi)開始通過云計算(suan)提(ti)供“基(ji)因(yin)云”等服務(wu)，因(yin)此未來更(geng)多“精(jing)準醫療”場景(jing)將首先通過“云計算(suan)”來實現(xian)。

此外，隨著基因(yin)測序的普及(ji)，“精準(zhun)醫療”產業(ye)鏈上的不同研究機構，將在可(ke)控條件(jian)下(xia)，交換(huan)共(gong)享基因(yin)數據，以提(ti)升各自(zi)在相關領(ling)域的研發能力和效率，建立(li)可(ke)控的共(gong)享基因(yin)數據庫。

曙光為超60家醫療機構提供“先進計算”方案

對此“趨勢”，中科曙(shu)光(guang)解(jie)決方案(an)中心技術總監楊莉表示，曙(shu)光(guang)很早便為醫療機(ji)構提供“先進計算”解(jie)決方案(an)。非典時期，曙(shu)光(guang)4000超(chao)級計算機(ji)無償協助完成了(le)SARS全基(ji)因組測序。

“‘精(jing)準醫(yi)(yi)(yi)(yi)療’發展(zhan)依靠對(dui)海量醫(yi)(yi)(yi)(yi)療數(shu)據(ju)信息的存儲、分析、利用，如何快速進(jin)行復(fu)雜(za)流程(cheng)的數(shu)據(ju)分析、將(jiang)海量數(shu)據(ju)轉(zhuan)化為可用信息，是精(jing)準醫(yi)(yi)(yi)(yi)療的難題，也是對(dui)先進(jin)計算平臺的挑戰。”楊(yang)莉表示，目(mu)前(qian)曙光已為“北(bei)京大學(xue)醫(yi)(yi)(yi)(yi)學(xue)部(bu)”、“四川省人民(min)醫(yi)(yi)(yi)(yi)院”等(deng)超12所三甲(jia)級醫(yi)(yi)(yi)(yi)院，以及“重慶市巴南醫(yi)(yi)(yi)(yi)院”、“江蘇泰(tai)州(zhou)市人民(min)醫(yi)(yi)(yi)(yi)院”等(deng)超50家普通醫(yi)(yi)(yi)(yi)院、縣級醫(yi)(yi)(yi)(yi)院、醫(yi)(yi)(yi)(yi)療機構等(deng)提(ti)供計算服務。

此外，曙光(guang)還與華大基(ji)因等“基(ji)因組學研發(fa)(fa)機(ji)構(gou)”合作，推動基(ji)因測(ce)序行業發(fa)(fa)展。而本(ben)次發(fa)(fa)布的(de)“趨勢”正是(shi)基(ji)于曙光(guang)為大量客戶提供(gong)解決方案實(shi)踐所得到的(de)。

北京邁基諾基因科技股份有限公司，首席IT架構與運維工程師王曉斌表示，目前“基因測序”數據作為“精準醫療”行業的基礎，是整個行業投入資源最多的領域之一。而第二、三代(dai)“基(ji)因測序”軟件(jian)，對計(ji)算(suan)平(ping)臺的IO讀寫穩定與帶寬，還(huan)有CPU性能要(yao)求較高。

王曉斌和同事(shi)在考察了多(duo)家供應商后(hou)，基于(yu)數據讀寫(xie)效率以及(ji)(ji)計算穩定(ding)性考慮，于(yu)2018年上半(ban)年采(cai)購了曙(shu)光(guang)可支持Infiniband網絡的并(bing)行存儲(chu)設備，以及(ji)(ji)四路服務器產品。

“從硬(ying)件到軟件，曙光對Infiniband架構(gou)并行儲(chu)存(cun)(cun)器都有(you)完善的(de)解決方案，對‘基因(yin)測(ce)序’軟件的(de)兼容(rong)性很(hen)好(hao)，整個存(cun)(cun)儲(chu)系統運行一年多很(hen)穩(wen)定(ding)。”王曉斌說(shuo)，今年他們還會繼續加大在存(cun)(cun)儲(chu)與計算設(she)備領域(yu)的(de)投(tou)入(ru)，以滿足業務(wu)增長需求。

目前，中(zhong)科曙光具(ju)備(bei)提供“精(jing)準醫(yi)療”全方(fang)位(wei)“先進計算”平臺的成熟經驗，對基因組、蛋白組、轉(zhuan)錄組和代謝組等組學技術的分(fen)析(xi)、存儲、共享(xiang)，以(yi)及(ji)精(jing)準醫(yi)療相關研究(jiu)中(zhong)大數據的分(fen)析(xi)、解讀，具(ju)有從硬件、軟件、維護的全面(mian)支持服務。

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