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首款國產分子育種固相基因芯片發布,驅動種業創新與糧食安全

蘇州(zhou)2024年5月13日(ri) /美(mei)通(tong)社/ -- 近(jin)期(qi)(qi),蘇州(zhou)拉(la)索生物芯(xin)(xin)(xin)片(pian)(pian)科(ke)技(ji)(ji)有限公司聯(lian)合(he)北(bei)京市農(nong)林(lin)(lin)科(ke)學院雜交小(xiao)麥研究所北(bei)京小(xiao)麥種子檢測中心(xin)、中國(guo)農(nong)業大學、西(xi)北(bei)農(nong)林(lin)(lin)科(ke)技(ji)(ji)大學等單(dan)位(wei),成(cheng)功研發出(chu)我國(guo)首款(kuan)具備完全(quan)知(zhi)識(shi)產權(quan)(涵蓋SNP標記、芯(xin)(xin)(xin)片(pian)(pian)、試劑(ji)及(ji)掃描儀)的高密度固(gu)相基因(yin)芯(xin)(xin)(xin)片(pian)(pian)——“華麥芯(xin)(xin)(xin)”普通(tong)小(xiao)麥基因(yin)分型65K芯(xin)(xin)(xin)片(pian)(pian)(簡稱“華麥芯(xin)(xin)(xin)65K”)。這(zhe)一創新成(cheng)果不僅填補了我國(guo)在該技(ji)(ji)術領域的長(chang)期(qi)(qi)空白,打(da)破了西(xi)方國(guo)家長(chang)達二十(shi)余(yu)年(nian)的技(ji)(ji)術壟斷,更是實現了關鍵(jian)核心(xin)技(ji)(ji)術的自主可控與(yu)全(quan)面國(guo)產化替代。


拉索生物(wu)高(gao)密(mi)度(du)固相基因芯片

過去二十多年間,我國(guo)基(ji)(ji)(ji)因(yin)檢(jian)測(ce)行業高度(du)依賴美國(guo)illumina和(he)Affymetrix公司的固(gu)相芯片(pian)產(chan)(chan)品,高昂的采(cai)購成本(ben)與技(ji)術差(cha)距(ju)曾一度(du)成為(wei)制約(yue)國(guo)內相關產(chan)(chan)業發展的因(yin)素,基(ji)(ji)(ji)因(yin)檢(jian)測(ce)成本(ben)居高不下(xia),難以(yi)直(zhi)接應用于(yu)分子(zi)育種(zhong)相關研究和(he)應用領域。國(guo)產(chan)(chan)高密度(du)固(gu)相基(ji)(ji)(ji)因(yin)芯片(pian)的成功研發,無(wu)疑為(wei)我國(guo)分子(zi)育種(zhong)事業的飛躍式發展開啟(qi)了新篇章。除了基(ji)(ji)(ji)因(yin)芯片(pian),拉索生物(wu)還提供包含(han)自(zi)研自(zi)產(chan)(chan)的掃描儀、試劑、配套軟(ruan)件及算法(fa)在內的一體(ti)化解決方案,有力推動(dong)了產(chan)(chan)業鏈的完(wan)善與優(you)化。


拉索生(sheng)物OmniScan芯(xin)片(pian)掃(sao)描儀

面對近年來科技(ji)快速(su)進步與成(cheng)(cheng)本壓力加劇,國內基因分型(xing)手段(duan)迅速(su)發展,諸如“液相(xiang)芯片”、“低(di)深度重測(ce)(ce)序”等低(di)成(cheng)(cheng)本、高通量(liang)(liang)的替代(dai)技(ji)術嶄(zhan)露頭角。然而,這些技(ji)術均依賴測(ce)(ce)序完(wan)成(cheng)(cheng)基因分型(xing),存在著(zhu)數(shu)據處(chu)理復雜、檢測(ce)(ce)周期長(chang)、實驗結果存在隨機(ji)性等問題。當樣本量(liang)(liang)巨大(da),或者基因組復雜程度高時,檢測(ce)(ce)成(cheng)(cheng)本也隨之攀升。

相較之下,固相芯(xin)片以固態基底(如載玻片)上(shang)的(de)寡核苷酸探針為基礎(chu),無需依(yi)賴測(ce)序(xu)或其他(ta)基因分(fen)型技(ji)術,即可一次性并行(xing)檢測(ce)數(shu)(shu)十萬至數(shu)(shu)百萬個SNP位(wei)點,從檢測(ce)到數(shu)(shu)據分(fen)析(xi),整個過程僅需72小(xiao)時,且(qie)準確率保持(chi)在(zai)99%以上(shang)。對于(yu)農(nong)業育種來說,提前拿到分(fen)型結果意味著能夠更早地進行(xing)淘汰選擇,從而節省大量成本并提高生(sheng)產效率。


微珠芯片構(gou)造示意(yi)圖(tu)

此外,固相基因芯片(pian)(pian)在(zai)檢(jian)測(ce)(ce)靈活(huo)性(xing)上亦(yi)顯現(xian)出顯著優勢(shi)。用戶可(ke)根據需要隨時添加(jia)新的(de)檢(jian)測(ce)(ce)位(wei)點,無需重(zhong)新定制新的(de)芯片(pian)(pian)。

尤其值得關(guan)注的(de)是,固相基因(yin)芯片在規模化檢測時展現出顯著的(de)成本(ben)(ben)效(xiao)益(yi)。隨著樣本(ben)(ben)數(shu)量增加,單個(ge)樣本(ben)(ben)的(de)檢測成本(ben)(ben)呈下(xia)降趨勢(shi),經濟效(xiao)益(yi)明顯。

截至(zhi)目(mu)前,蘇州拉(la)索(suo)生物芯片公司已獲得(de)13項(xiang)發(fa)明(ming)專利授(shou)權、2項(xiang)實(shi)用新型專利授(shou)權、1張醫療器械注(zhu)冊證,是中國法律體系下,在高密度固(gu)相(xiang)基因芯片研發(fa)和生產領域知識產權布局最(zui)完(wan)善的(de)公司。其主(zhu)要供應商立足本土(tu),不受國際環境波(bo)動影響,確保產品穩(wen)定供應。專業的(de)本土(tu)技(ji)術支持團隊提供全程高效服務(wu),確保用戶無憂(you)使(shi)用。


拉索生物發明專利證書

“華麥芯”普通小麥基因分型65K芯片

華麥(mai)芯(xin)65K嚴格遵(zun)照《小麥(mai)品(pin)種真(zhen)實性(xing)鑒(jian)定(ding)SNP標(biao)記(ji)法(fa)》(NY/T 4021-2021),囊括真(zhen)實性(xing)鑒(jian)定(ding)和(he)(he)已知品(pin)種高密度(du)指紋數據庫構建(jian)的所有位點(dian)(dian),并整合轉基(ji)因(yin)檢(jian)測所必需的特定(ding)標(biao)記(ji)物,以及部分(fen)與小麥(mai)產(chan)量、品(pin)質、抗(kang)病等功(gong)能基(ji)因(yin)或緊密連鎖的SNP標(biao)記(ji)。以中國春2.1版本為參(can)考,目前包(bao)含54993個(ge)精選的SNP標(biao)記(ji)(可根(gen)據未來研究重(zhong)要結果擴充至65K),覆(fu)蓋196個(ge)性(xing)狀(zhuang)相關(guan)標(biao)記(ji)。SNP位點(dian)(dian)在(zai)A、B、D染色體上分(fen)布(bu)較均(jun)(jun)衡,多態性(xing)位點(dian)(dian)占比高達99.1%,具備良(liang)好的區分(fen)能力和(he)(he)穩定(ding)性(xing);單(dan)個(ge)SNP位點(dian)(dian)采用15-30個(ge)微球重(zhong)復檢(jian)測,平均(jun)(jun)檢(jian)出(chu)率(lv)高達99.0%,再現性(xing)高達99.5%。


華麥芯65K實物圖

結合國產高密度固相基因(yin)芯片(pian)制備技(ji)術(shu),華麥芯65K具備以下顯著優(you)勢:

全自主:從芯片制備(bei)到(dao)掃描(miao)儀(yi)、試(shi)劑、配套軟件及算法在(zai)內(nei)的一體(ti)化解決方案均可自主實現(xian)。

可擴充:可根據需要(yao)在原有芯片基(ji)礎上隨(sui)時添(tian)加新(xin)的檢(jian)測位(wei)點,無需重(zhong)新(xin)定制新(xin)的芯片,靈活性(xing)(xing)高、可塑(su)性(xing)(xing)強。

多效用:該芯片集(ji)背景篩選、品種鑒(jian)定、轉(zhuan)基(ji)因(yin)檢測(ce)等(deng)多用途于一(yi)體,可(ke)實現一(yi)站(zhan)式全面篩查(cha),大幅提高檢測(ce)效率,并節約(yue)成(cheng)本。

低成本:固相芯(xin)片在規模(mo)化檢(jian)測(ce)時(shi)展現(xian)出顯著的成本(ben)(ben)效益(yi)(yi)。隨著樣本(ben)(ben)數(shu)量增加,單個(ge)樣本(ben)(ben)的檢(jian)測(ce)成本(ben)(ben)呈(cheng)下降(jiang)趨勢,經濟效益(yi)(yi)明顯。

高效率:固(gu)相芯片以固(gu)態基底上的(de)寡(gua)核(he)苷酸探(tan)針為基礎,無(wu)需(xu)依(yi)賴(lai)測(ce)序或其(qi)他基因分型(xing)技術(shu),即(ji)可一(yi)次性并行檢(jian)測(ce)數十萬至數百萬個(ge)SNP位點,從檢(jian)測(ce)到數據分析(xi),整個(ge)過(guo)程僅需(xu)72小時,且準確(que)率保持在99%以上。同時,僅需(xu)24個(ge)樣(yang)本即(ji)可完成檢(jian)測(ce),無(wu)需(xu)湊樣(yang)。

芯片可廣(guang)泛應用于(yu):小麥品種(zhong)真實性/特異性/一(yi)致性輔(fu)助(zhu)檢測,實質派生品種(zhong)診斷,轉(zhuan)基(ji)因檢測,遺傳連鎖圖(tu)譜(pu)構建與QTL定位,全基(ji)因組選擇育(yu)種(zhong),標(biao)記輔(fu)助(zhu)選擇育(yu)種(zhong)等。

華麥“芯”普通小(xiao)麥基因(yin)分(fen)型(xing)65K芯片的誕(dan)生(sheng),不(bu)僅為我國小(xiao)麥育種(zhong)工(gong)作(zuo)提(ti)供了強大(da)(da)工(gong)具,更預示著我國固相基因(yin)芯片技術將在更多農作(zuo)物種(zhong)類及研究領(ling)域展現出巨大(da)(da)潛力。未來,拉索生(sheng)物將持(chi)續聚焦玉(yu)米、大(da)(da)豆等(deng)主糧作(zuo)物,以及生(sheng)豬、肉雞、奶牛等(deng)多元化農業領(ling)域的育種(zhong)技術革新,推動我國農業向更高效率、更高精度、更高自主性的方(fang)向大(da)(da)步邁進。

每一輪(lun)技(ji)術創新都(dou)有可能觸(chu)發(fa)(fa)農業(ye)革命,每一顆(ke)優質(zhi)的種子(zi)都(dou)蘊含著(zhu)豐產的希望。拉索生物正以(yi)實際行動踐行“通過國產自(zi)主研發(fa)(fa)和持(chi)續創新,推動基因檢測技(ji)術在更多(duo)場景的應用(yong)和普及”的宏偉愿景,為我國乃至全球的糧(liang)食安全與農業(ye)現代化(hua)進程貢獻力量。

消息來源:蘇州拉索生物芯片科技有限公司
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